实验准备:wako质谱级赖氨酰肽链内切酶125-05061
单位定义
wako质谱级赖氨酰肽链内切酶125-05061的酰胺酶单位定义为在30℃、pH 9.5条件下,每分钟生成1μmol对硝基苯胺所需的酶量。单位计算公式为:AU/vial=[(a-b)/25] × (1/962) × (40/01)
其中,a代表检测样品中的吸光度,b为空白对照的吸光度。
实验操作流程
为了避免捕获任何蛋白质,建议使用聚硅酮处理的微量离心管和吸管。对于质谱分析,可以选择质谱分析专用的凝胶染色试剂盒,例如银染剂MS试剂盒(产品编号:299-58901)和负凝胶染色MS试剂盒(产品编号:293-57701)。实验步骤如下:- 电泳分离蛋白质样品。
- 从凝胶中切割蛋白质片段,并放入微量离心管中。
- 使用脱色溶液脱色凝胶。
- 向试管中加入300μL乙腈,搅拌器震荡30分钟。
- 去除乙腈,用Parafilm膜封住微量离心管。
- 在Parafilm膜上打出针孔,进行真空干燥15分钟。
- 将100μL 10mmol/L DTT溶解于100mmol/L碳酸氢铵中,并在56℃下恒温1小时。
- 室温冷却后,加入等量的50mM碘乙酰胺溶解于100mmol/L碳酸氢铵,暗处恒温45分钟并涡旋。
- 用100μL 100mmol/L碳酸氢铵洗涤凝胶片段10分钟。
- 用300μL乙腈干燥凝胶片段15分钟。
- 用100μL 100mmol/L碳酸氢铵进行凝胶片段的胀化15分钟。
- 再次用300μL乙腈干燥凝胶片段15分钟。
- 去除液相,继续真空干燥凝胶片段15分钟。
- 使用100μL赖氨酸内切酶溶液在冰水浴中溶胀凝胶片段45分钟。
- 移除100μL赖氨酸内切酶溶液,将凝胶片段放置于37℃、10μL 50mmol/L Tris-HCl (pH 8.5)中过夜。
- 加入50μL 20mmol/L碳酸氢铵,并在20分钟内搅拌凝胶片段,提取多肽3次。
- 用5%甲酸/50%乙腈在20分钟内搅拌凝胶片段,再次提取多肽3次。
- 如有需要,可使用SpeedVac浓缩多肽。
- 使用ZipTip进行多肽脱盐和纯化。
- 如需要,可以弱真空浓缩多肽至2μL。
- 最后,添加基质进行质谱分析。