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尊龙凯时噬菌体免疫沉淀测序技术解析抗体组的生物医疗应用

发布时间:2025-03-26   信息来源:尊龙凯时官方编辑

噬菌体免疫沉淀测序(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)技术近年来成为生物医学领域的一个研究热点。这是一项结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀和高通量测序技术的高通量筛选技术,能够进行基于抗原-抗体匹配的全局性抗体库(Antibody repertoire)分析。该技术因其高灵敏度和高通量检测能力,广泛应用于自身抗体组研究、感染性疾病相关抗体以及疫苗研发等领域,为解决复杂的免疫学问题提供了强有力的工具,在生物医学研究中展现出重要的应用价值。

尊龙凯时噬菌体免疫沉淀测序技术解析抗体组的生物医疗应用

近期,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在免疫学顶刊《Immunity》上接连发表了两篇重要文章,基于噬菌体免疫沉淀检测(PhIP-seq)技术对人血清的抗体库进行了深入的构建与分析,并识别出了炎症性肠病(IBD)的特征抗体标志物。这两项研究使用了相同的噬菌体展示肽库,筛选了超过1000例血清样本,从不同角度进行了综合分析。该噬菌体展示肽库包含344,000条多肽,其对应的蛋白质来源于微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌)以及致病因子数据库(VFDB)和免疫表位数据库(IEDB)。每条肽的单个长度为64个氨基酸,且相邻肽之间存在20个氨基酸的重叠。

第一篇文章专注于炎症性肠病(IBD)患者的抗体组分析。研究者通过高通量噬菌体展示免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术,检测了497例IBD患者与1326例健康对照的血清抗体。通过对比分析,他们发现炎症性肠病患者的抗体表位谱与健康对照之间存在显著差异,确认了373种IBD差异表达的抗体反应(包括202种过度表达和171种低表达)。有趣的是,17%的反应在IBD的两种形式中均存在,55%仅存在于克罗恩病(CD),而28%仅在溃疡性结肠炎(UC)中被检测到。这些多肽之间的共线性提示它们可能共享类似的抗体识别基序或结构域。

除了上述发现,研究还评估了这些多肽与患者临床特征之间的相关性,发现与疾病活动度、炎症指标及并发症相关。这些抗体反应可能源于发病前的遗传易感性,并在发病后的状态中被激活或重新定向。接下来,研究团队选择了一小部分差异化的肽段,利用递归特征消除(RFE)方法建立和优化模型,成功区分了IBD患者与对照样本。最终,抗体表位谱能准确区分克罗恩病患者与健康对照(曲线下面积[AUC]=0.89),即使仅用10个抗体也能实现较高的区分精度(AUC=0.87)。

这些特异性的多肽为炎症性肠病的诊断提供了新的可能性,为未来的研究方向指明了前进的道路。随着噬菌体免疫沉淀测序技术的进一步发展,其在生物医学研究中的应用前景将更加广阔。可以预见,像尊龙凯时这样的品牌将继续推动这一领域的创新与进步。